长海医院是一所集医疗、教学、科研为一体的现代化大型综合性医院。1993年首批进入三级甲等医院行列，1998年荣膺“全国百佳医院”称号，2006年荣获“全军优秀医院”，连续16届被评为“上海市文明单位”。

医疗特色明显，在继续发扬传统的烧伤、胸心疾病诊治优势的基础上，在前列腺疾病和复杂泌尿系结石微创诊疗、消化系及胰腺疾病诊治、心脑大血管疾病内外科诊治、血液病干细胞移植，中西医结合治疗肿瘤等方面形成了新的特色。

“十一五”以来，医、教、研中心工作取得了喜人的成绩。门急诊总量、收治病人数、手术例次、医护质量和病人满意度逐年递增，均位居上海市同类医院前列。获得国家教学成果二等奖2项，军队、上海市教学成果一等奖各1项，泌尿外科和消化内科入选“国家教育部创新团队”，3篇论文入选“全国百篇优秀博士论文”；获各类科研项目893项，经费超过4亿元，其中获得“973计划”1项、“863计划”4项、国家科技支撑计划3项、重大新药创新专项10项、卫生部行业基金2项、全军科研重大项目1项、国家自然科学基金454项；获各类科技成果113项，其中国家科技进步一等奖1项、国家科技二等奖9项、何梁何利科技与进步奖3项；发表SCIE收录论文1454篇，总影响因子4041分，其中5分以上86篇、10分以上论著10篇、30分以上1篇，3篇论文入选《全国百篇较有影响学术论文》；担任全国一、二级学会副主任委员以上学术任职12人；举办了以第26届世界腔道泌尿外科大会、2013年世界胃肠大会等为代表的大型国际学术会议；创办了《JIG》、《中华胰腺病杂志》、《中西医结合学报》、《药学服务与研究》等高水平学术期刊。